ご祭神： 大御饌津彦命 （おおみけつひこのみこと）
天児雲根命（あめのこやねのみこと）の御子、天忍雲根神（あめのおしくもねのかみ）を尊称し奉ったもので、古来、食物農業の神として崇められている。
平安時代の延長5年（927年）にまとめられた日本全国の神社図鑑「延喜式神名帳」に船井郡の「名神大社」と記されている式内社です。承暦3年（1079年）には白河天皇の行幸があり、神事祭礼を旧に復し、「船井第一麻氣大社」の勅額を賜り、その社号を宣下された。
園部藩主小出氏累代の祈願所として、一切の建物は官営であったが、宝暦11年（1762年）、不幸にして火災を被り全焼する。明和4年（1767年）、時の藩主小出英持公により、一切の建物が再建され今日に至る。
大正5年（1916年）3月に府社に列し、神域広大、摩氣郷十一ヶ村の総社として尊崇された。
郷名は「みけ」の祭神名により起こり、転音して「まけ」となる。
毎年六月は御田植祭り、例祭神幸祭に行う練り、角力流鏑馬等の神事は由緒深いものである。
茅葺きの覆屋内に鎮座する本殿・東摂社・西摂社は京都府指定文化財で、境内は京都府文化財環境保全地区です。その趣から、時代劇のロケ地としてたびたび使用されています。
（一） 神域（境内） 一六〇〇坪
京都府文化財環境保全地区（昭和59年［1984］指定）
（二） 建造物
京都府文化財保護建造物（昭和59年４月指定）
本殿一 三間社流造り 明和４年（1967）８月再建
摂社二 三間及び二間社流造り 明和４年（1967）８月再建
京都府登録文化財（昭和59年４月指定）
絵馬舎 明和４年（1967）８月再建
神門一 文化五年（1808）再建
石造大鳥居一 寛文十二年（1672年）
≪摩氣神社の摂社≫
東西の摂社には向かって右より、菅原大神（宍人）、大森大神（半田）、菅原大神（半田）、熊野大神（黒田）、加茂大神（城南）、三輪大神（上横田）、若宮大神（下横田）、月読大神（志和賀）、向かって左より葛城大神（京丹波町八田）、八幡大神（船阪）八幡大神（西山）、八幡大神（大坪）、蛭子大神（仁江）、山王大神（胡麻）を祀っているのである。
志和賀村は現日吉町である。