ご祭神： 大御饌津彦命 （おおみけつひこのみこと）
天児雲根命（あめのこやねのみこと）の御子である天忍雲根神（あめのおしくもねのかみ）の別称で、古来より食と農業の神として広く崇敬されています。
創祀の年代等は不詳だが西暦770年には祭祀が行われていた。平安時代の延長5年（927年）に編纂された、日本全国の神社を網羅した「延喜式神名帳（えんぎしきじんみょうちょう）」には、船井郡の「名神大社」として記載されており、格式高い式内社です。
承暦3年（1079年）には白河天皇の行幸があり、神事や祭礼が旧に復され、「船井第一麻氣大社」の勅額を賜り、その社号が宣下されました。
江戸時代には園部藩主・小出氏の祈願所として尊崇され、社殿などすべての建物は官費により維持されていましたが、宝暦11年（1762年）に不幸にも火災により全焼。その後、明和4年（1767年）、時の藩主・小出英持公によりすべての建物が再建され、現在に至ります。
大正5年（1916年）3月には府社に列せられ、神域は広く、摩氣郷十一ヶ村の総社として人々の厚い信仰を集めてきました。なお、「摩氣（まけ）」という郷名は、御祭神「みけ」から起こり、転音して「まけ」となったものです。
毎年6月には御田植祭が斎行され、10月の例祭である神幸祭では練り、角力（すもう）、流鏑馬（やぶさめ）など、由緒ある神事が盛大に行われています。
また、茅葺きの覆屋内に鎮座する本殿・東摂社・西摂社は京都府指定文化財に指定されており、境内は「京都府文化財環境保全地区」にも指定されています。その風情ある景観から、時代劇のロケ地としてもしばしば使用されています。
（一） 神域（境内） 一六〇〇坪
京都府文化財環境保全地区（昭和59年［1984］指定）
（二） 建造物
京都府文化財保護建造物（昭和59年４月指定）
本殿一 三間社流造り 明和４年（1967）８月再建
摂社二 三間及び二間社流造り 明和４年（1967）８月再建
京都府登録文化財（昭和59年４月指定）
絵馬舎 明和４年（1967）８月再建
神門一 文化五年（1808）再建
石造大鳥居一 寛文十二年（1672年）
≪摩氣神社の摂社≫
東西の摂社には向かって右より、菅原大神（宍人）、大森大神（半田）、菅原大神（半田）、熊野大神（黒田）、加茂大神（城南）、三輪大神（上横田）、若宮大神（下横田）、月読大神（志和賀）、向かって左より葛城大神（京丹波町八田）、八幡大神（船阪）八幡大神（西山）、八幡大神（大坪）、蛭子大神（仁江）、山王大神（胡麻）を祀っているのである。
志和賀村は現日吉町である。